Videoprehliadka
Prezrite si videoprehliadku nášho laboratória metabolomiky.
Menu
Laboratórium metabolomiky ponúka cielenú a necielenú metabolomickú analýzu pomocou vysokošpecializovaných prístrojov, vrátane kombinácie kvapalinového chromatografu s hmotnostným spektrometrom (s presnosťou 0,0001 Da) a 600 MHz NMR spektrometra.
Metabolizmus buniek je základným znakom života a jeho následkom vznikajú v živom organizme metabolity. Analýza zmien ich koncentrácie predstavuje jeden zo základných diagnostických nástrojov súčasnej medicíny. Laboratórium metabolomiky ponúka cielenú a necielenú metabolomickú analýzu pomocou vysokošpecializovaných prístrojov, vrátane hmotnostného spektrometra (s presnosťou 0,0001 Da) a 600 MHz NMR spektrometra. Zameriavame sa najmä na metabolické analýzy nízkomolekulových látok v tkanivách, bunkových kultúrach a biologických tekutinách (krvná plazma, moč, likvor, extrakty tkanív, bunkové média a lyzáty).
Laboratórium disponuje aj experimentálnym 7 Teslovým skenerom na báze magnetickej rezonancie, pomocou ktorého dokážeme neinvazívne zobrazovať (MRI) nielen biologické systémy, ale aj iné typy vzoriek. Zobrazovacie sekvencie umožňujú sledovanie širokej škály in vivo, ex vivo a in vitro procesov, a preto sú vhodné aj na monitorovanie funkcionalizovanej terapie pomocou magnetických nanočastíc (teranostika). Navyše, využitím spektroskopických metód (MRS), vieme sledovať biochemické profily skúmaných tkanív, vrátane dynamických farmakologických a metabolických dejov in vivo.
Prezrite si videoprehliadku nášho laboratória metabolomiky.
NMR spektrometer Bruker Avance III 600 MHz
MRI/MRS skener Bruker BioSpec 70/20 USR 7 T
Zariadenie na anestéziu RWD s inhalačnou látkou izoflurán
Kombinácia kvapalinového chromatografu Agilent s vysoko-rozlišovacím hmotnostným spektrometrom Bruker Q-TOF
Predstavujeme vám virtuálnu prehliadku nášho moderného laboratória metabolomiky.
Riešené projekty
Projekt APVV č. SK-AT-20-0010, „Multiparametrické vyšetrenia Miyoshiho myopatie pomocou modalít magnetickej rezonancie“ (Laboratórium figuruje ako zodpovedný riešiteľ, v spolupráci s Medical University of Vienna;High-Field MR Center, Department of Biomedical Imaging and Image-Guided Therapy, Vienna, Austria)
Projekt APVV č. APVV-15-0107, „Úloha vitamínu D a ďalších markerov vo vzťahu k priebehu sclerosis multiplex.“ (Laboratórium figuruje ako spoluriešiteľ, v spolupráci s UNM a JLF UK)
Najvýznamnejšie publikácie
Strbak O, Balejcikova L, Kmetova M, Gombos J, Kovac J, Dobrota D, Kopcansky P. Longitudinal and transverse relaxivity analysis of native ferritin and magnetoferritin at 7 T MRI. International Journal of Molecular Sciences 2021, 22, 8487. doi:10.3390/ijms22168487
https://www.mdpi.com/1422-0067/22/16/8487
Baranovicova E, Kalenska D, Tomascova A, Holubcikova S, Lehotsky J. Time-related metabolomics study in the rat plasma after global cerebral ischemia and reperfusion: Effect of ischemic preconditioning. IUBMB Life 2020, 72:2010-2023. doi: 10.1002/iub.2340
https://iubmb.onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1002/iub.2340
Hnilicova, P., Strbak, O., Kolisek, M., Kurca, E., Zelenak, K., Sivak, S., Kantorova, E. Current methods of magnetic resonance for noninvasive assessment of molecular aspects of pathoetiology in Muliple Sclerosis. Int J Mol Sci2020, 21:6117. doi: 10.3390/ijms21176117
https://www.mdpi.com/1422-0067/21/17/6117
Kovalska M, Hnilicova P, Kalenska D, Tomascova A, Adamkov M, Lehotsky J: Effect of Methionine Diet on Time-Related Metabolic and Histopathological Changes of Rat Hippocampus in the Model of Global Brain Ischemia. Biomolecules 2020, 10:1-20. doi: 10.3390/biom10081128
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7465067/
Grayston A, Zhang YJ, Garcia-Gabilondo M, Arrue M, Martin A, Kopcansky P, Timko M, Kovac J, Strbak O, Castellote L, Belloli S, Moresco RM, Picchio M, Roig A, Rosell A. Endovascular administration of magnetized nanocarriers targeting brain delivery after stroke. Journal of Cerebral Blood Flow and Metabolism 2021, 42, 237-252. doi:10.1177/0271678X211028816
Strbak O, Balejcikova L, Kmetova M, Gombos J, Trancikova A, Pokusa M, Kopcansky P. Quantification of iron release from native ferritin and magnetoferritin induced by vitamins B2 and C. Int J Mol Sci 2020, 21:6332. doi:10.3390/ijms21176332
https://www.mdpi.com/1422-0067/21/17/6332
Baranovicova E, Galanda T, Galanda M, Hatok J, Kolarovszki B, Richterova R, Racay P. Metabolomic profiling of blood plasma in patients with primary brain tumours: Basal plasma metabolites correlated with tumour grade and plasma biomarker analysis predicts feasibility of the successful statistical discrimination from healthy subjects – a preliminary study. IUBMB Life 2019, 71:1994-2002. doi: 10.1002/iub.2149
https://iubmb.onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/iub.2149
Hnilicová,P., Bálentová, S., Kalenská, D., Muríň, P., Hajtmanová, E., Lehotský, J., Anatomic and metabolic alterations in the rodent frontal cortex caused by clinically relevant fractionated whole-brain irradiation. Neurochemistry International 2022, 154, 105293. doi: 10.1016/j.neuint.2022.105293
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0197018622000183?via%3Dihub
Baranovicova E, Kalenska D, Tomascova A, Lehotsky J. Metabolomic study of altered energy metabolism during global forebrain ischemia and ischemic precoditioning in blood plasma in homocysteine treated rats. J Physiol Pharmacol 2018, 69:901-909. doi: 10.26402/jpp.2018.6.04
http://www.jpp.krakow.pl/journal/archive/12_18/pdf/10.26402/jpp.2018.6.04.pdf
Heckova, E., Dal-Bianco, a., Strasser, B., Hangel, G.H., Lipka, L., Motyka, s., Hingerl, L., Rommer, P.S., Berger, T., Hnilicová, P., Kantorová, E., Leutmezer, F., Kurča, E., Gruber, S., Trattnig, S., Bogner, W., Extensive Brain Pathologic Alterations Detected with 7.0-T MR Spectroscopic Imaging Associated with Disability in Multiple Sclerosis. Radiology 2022, 303, 141-150. doi:10.1148/radiol.210614
Výsledkom projektu BioMed Martin, financovaného z EÚ, je prevratné výskumné centrum, ktoré vyvíja nové diagnostické a terapeutické metódy a súčasne posilňuje spoluprácu medzi mestom Martin a Žilinským krajom na Slovensku.